什麼是連結的檔案
ZotFile 和 ZotMoov 是 Zotero 的附加元件：它們把論文的 PDF 從 Zotero 自己的儲存空間移到你的資料夾裡（通常是 Dropbox、Google 雲端硬碟或 OneDrive 同步的那種），只在項目上留下指向它的連結。Zotero 把這種附件叫作連結的檔案。
連結的檔案不會隨 Zotero 同步走：Zotero 保存的是項目，PDF 在你的雲端資料夾裡。所以這樣的論文無法像一般附件那樣下載——沒有可以下載的地方。
PDF 是連結的檔案的論文，在文獻庫中會標示為 連結。
解決辦法和 Zotero 自己的一樣：每台裝置都指向同一個資料夾。只要告訴 Rectoly 這個資料夾在本裝置上的位置，論文就能開啟。
選擇資料夾和使用尋找位置…都是免費的。開啟連結的論文與一般下載相同：包含在購買中，14 天免費試用期內免費，開始試用前第一篇論文免費。請參閱試用與購買。
選擇基準資料夾
在電腦上的 Zotero 中，這個資料夾是設定 → 進階 → 檔案與資料夾 → 連結的附加檔來源目錄。先去那裡看一眼，就知道該選哪個資料夾了。
- 在 Rectoly 中開啟設定：
- 設定 ›同步與備份 ›連結的檔案（ZotFile、ZotMoov）。
- 設定 ›同步 ›連結的檔案（ZotFile、ZotMoov）。
- 按選擇資料夾，選中本裝置上的那個資料夾。
- 原本顯示未設定的一行會變成所選的資料夾。取消設定可以清除它。
各系統上到哪裡去找這個資料夾：
- 選擇器是「檔案」App。請選其中顯示的 Dropbox、Google 雲端硬碟、OneDrive 或 iCloud 雲碟資料夾；相應的應用程式必須已安裝，它的資料夾才會出現。在 Mac 上也可以直接在 Finder 中選擇，例如
~/Library/CloudStorage/下面的資料夾。 - 在檔案對話方塊裡選同步資料夾：
C:\Users\<你>\Dropbox\…、Google 雲端硬碟的G:磁碟機、OneDrive 資料夾，或任何由同步軟體在這台電腦上保持最新的資料夾。
Rectoly 會向系統申請對該資料夾的長期讀取權限，而且只申請讀取。
這個資料夾不必與 Zotero 的基準目錄完全一致。如果 Zotero 那邊是 Dropbox/Zotero 而你選了 Dropbox，Rectoly 照樣能找到檔案；即使找不到，你用尋找位置…指出的第一個檔案也會讓它學會剩下的路徑。
基準資料夾屬於這台裝置和這個帳戶——同一個雲端資料夾在每台裝置上的路徑都不一樣——所以任何備份都不會帶走它，登出該帳戶時它會被清除。
開啟連結的論文
像平常一樣開啟論文。Rectoly 會從基準資料夾順著連結找過去，把 PDF 複製到自己的存放處再開啟。螢光標示、便利貼、手寫和閱讀模式都與其他論文完全一樣。
複製是刻意的：Rectoly 會把註解和手寫當成小檔案放在自己那份 PDF 旁邊，如果寫進你的 Dropbox 資料夾，就會多出你沒要過的檔案。複製之後，你的資料夾保持原樣。
如果資料夾裡的 PDF 之後變了（你在電腦的其他應用程式裡寫過，或者 ZotFile 換掉了它），Rectoly 會透過大小和修改日期發現，並在你下次開啟這篇論文時重新複製。
連結的檔案只存在於我的文獻庫中；Zotero 不允許群組文獻庫使用它們。
找不到檔案時
有時基準資料夾已經設好，偏偏這一個 PDF 不在連結所指的位置（資料夾被改名，或者電腦上的基準目錄和你選的資料夾不是同一個）。這時 Rectoly 會顯示 找不到連結的檔案：…，並提供尋找位置…。
請自己選中那個檔案。Rectoly 會開啟它，並比較連結所指的位置與檔案的實際位置。它從兩者的差別推出一條規則，套用到你其他連結的論文上，然後說 已找到。同一資料夾中的其他 PDF 現在也能開啟了。 實際使用中，通常一次尋找位置…就夠整個文獻庫用了。
你選的檔案必須在基準資料夾裡面。如果不是，Rectoly 會提示你：請把基準資料夾換成包含這些 PDF 的那一個，或者選擇所選資料夾裡面的檔案。
Rectoly 會做什麼、不會做什麼
- Rectoly 不會改動資料夾裡的檔案。 它只讀取，不改名、不把註解寫進去、不移動、不刪除。
- 新加入的 PDF 不會變成連結的檔案。 你在 Rectoly 裡加入的 PDF 仍然進入 Zotero 儲存空間或你的 WebDAV 伺服器。製作連結的檔案是電腦上附加元件的工作。請參閱把 PDF 加入 Zotero和 WebDAV 伺服器上的檔案。
- 不會上傳到任何地方。 資料夾是在本裝置上讀取的，其內容不會經過 Rectoly 的伺服器。請參閱你的資料。
- 連結的檔案與 WebDAV 是兩項各自獨立的設定，可以同時使用：被 ZotFile 移走的檔案從資料夾取，其餘的從 Zotero 儲存空間或你的 WebDAV 伺服器取。
出問題時
| Rectoly 的提示 | 含意與處理 |
|---|---|
| 此 PDF 連結到電腦上的某個資料夾（ZotFile、ZotMoov 等） | 還沒有在本裝置上選擇基準資料夾。請參閱選擇基準資料夾。 |
| 找不到連結的檔案：… | 資料夾已設定，但連結所指的位置沒有這個檔案。請使用尋找位置…，見找不到檔案時。 |
| Rectoly 已無法讀取該資料夾 | 權限沒有了：資料夾被改名或移動、同步應用程式被重新安裝，或者裝置做過還原。請重新選擇該資料夾。 |
| 無法讀取連結的檔案 … | 檔案只在雲端，還沒有下載到裝置上。請開啟 Dropbox 或 Google 雲端硬碟應用程式，把該檔案（或整個資料夾）設為可離線使用，然後重試。 |
| 你選擇的檔案不在基準資料夾內 | 尋找位置…只能連結基準資料夾裡面的檔案。請選裡面的檔案，或改用範圍更大的基準資料夾。 |
| 目前無法存取該資料夾 | 磁碟沒有連接，或者同步應用程式沒有執行。請啟動它或重新連接磁碟，然後重新開啟論文。 |
診斷資料裡只會記錄失敗的種類，不會記錄資料夾或檔案的名稱。請參閱遇到問題時。