你在 iPad 上打开一篇论文，在一句话下面画了一道线。这道线现在在哪里？
答案并不是对每一种标记都相同，也不是对每一种把论文装进 iPad 的方式都相同。这篇文章逐一说明 Mendeley 能保存什么、不能保存什么，以及这对你即将做的标记意味着什么。
Mendeley 把什么存为批注
Mendeley 自己的开发者文档把批注定义为一种类型加上页面上的一个位置。类型有三种：
| 类型 | 它是什么 | 如何定位 |
|---|
highlight | 一段被高亮的文字 | 一个外接矩形：左上角和右下角 |
sticky_note | 钉在某一点上的便签 | 同样的矩形，但宽高为零，也就是一个点 |
note | 针对整篇文献的评论 | 没有页面位置 |
批注还带有颜色、创建它的用户资料，以及它是私有还是与群组共享。坐标以排版点为单位，从页面左下角起算。
模型就是这些。它很适合人们对文本做的事（标出一段、把评论钉在某处），也意味着这些标记是结构化数据，而不是固化到文件里的像素。它还带来一个在 iPad 上很要紧的结果，这篇文章接下来讲的就是它。
如果你在浏览器里批注
Mendeley 的网页版可以高亮和添加笔记，它们会直接以上面的类型进入你的文献库。什么都不会被落下：你在网页上做的，在电脑上也在。
限制来自浏览器本身。没有压感输入，没有防误触，页面就是页面，你只能在屏幕给你的尺寸下工作。
如果你在另一个 PDF 应用里批注
下载 PDF，用阅读器打开，在那里做标记。这是批注工具最好的一条路，也是你的标记离开文献库的一条路。
你做的批注属于那个应用里的那份文件副本。Mendeley 不知道它们发生过。编目里的论文和批注过的论文现在成了两个不同的东西，而你的引用指向的那一篇不是你写过字的那一篇。几个月之后，这件事真的很难理清，所以值得早做决定，而不是在写文献综述时才发现。
有些阅读器能把批注作为扁平化的 PDF 或摘要导出。这有帮助，但扁平化的批注已经不是结构化数据：它不能像原生高亮那样在 Mendeley 里被搜索、按颜色筛选或编辑。
如果你在会同步的应用里批注
登录你的 Mendeley 账户的应用，可以通过网页版使用的同一个 API 创建批注。在 iPad 上画的高亮会以同样的坐标、同样的颜色成为你文献库里的一条 highlight，而上个月在电脑上画的高亮，在 iPad 上打开论文时也在那里。
这是唯一一条论文只有一份而不是两份的路。
这一类应用之间的差别，在于你的哪些标记能走完这趟旅程。这就说到了走不了的那一种。
为什么手写不一样
再看一遍这个模型：一种类型，加上页面上的一个矩形。
手写的一笔不是矩形。它是一条路径：一串点，带着压力和倾斜，粗细沿途变化。Mendeley 的批注模型里没有任何字段能装下它。这不是某个应用没有把功能做出来，而是这种格式根本没有为这种形状留位置。
所以没有任何应用能把你的 Apple Pencil 手写变成 Mendeley 批注。并非所有文献库都是这样设计的：Zotero 的格式确实为墨迹留了位置，这一点在Zotero 如何处理你在 iPad 上做的批注里有详细说明。凡是声称能做到的，做的都是别的事：要么把墨迹扁平化成像素固化进 PDF，要么把它存在 Mendeley 之外的某个地方再显示给你看。
后一种是诚实的做法，而且值得弄清一个应用用的是哪一种，因为当你在别处打开这篇论文时，两者的表现截然不同。
离线时，以及两台设备意见不一时
还有两件事决定批注在一个学期里用起来的感受。
离线。没有网络时做的标记必须先在本地保存，等有网络时再发送。只在你落笔那一刻通过 API 写入的应用，会丢掉你在飞机上写的东西。
冲突。两台设备，都有你的文献库，都做了编辑。或者一次同步要删掉的批注比它应该删的多。批注不是那种“新的那份悄悄获胜”就可以的数据：一个学期的页边笔记没有撤销。值得知道一个应用是悄悄解决它，还是停下来告诉你。
Rectoly 处在哪里
Rectoly 创建的是真正的 Mendeley 批注。在 iPad 上做的高亮、下划线和便签会作为批注出现在你的文献库里，在别处做的批注在你打开论文时也在那里。一份副本，两个方向。
手写走的是上面第二条路里诚实的那一种。因为 Mendeley 没有墨迹类型，Apple Pencil 的笔画被保存在批注模型之外：除非你把它关掉，它们会作为附加文件存在 Mendeley 的文献条目上，由 Rectoly 把它们从你的一台设备带到下一台。在 iPad 上写，再在 Windows 或 Mac 的 Rectoly 里打开同一篇论文，笔画就在那里，在页面上的同一个位置。它们做不到的，是在 Mendeley 自己里面画在页面上，因为那里没有能画出它们的东西。
离线时做的标记保存在设备上，重新联网后上传。如果一轮同步会抹掉一篇论文的大部分手写，或者两台设备意见不一，Rectoly 会停下来告诉你，而不是悄悄处理掉。
常见问题
我能在 iPad 上给 Mendeley 的 PDF 高亮，然后在电脑上看到吗？
能，只要你用的应用是通过你的 Mendeley 账户创建批注的。高亮、下划线和便签正是 Mendeley 保存的类型，所以它们会像任何其他批注一样出现在电脑上。
为什么我的 Apple Pencil 手写在 Mendeley 里看不到？
Mendeley 的批注模型包括高亮、便签和笔记，每一种都由页面上的一个矩形定位。手写的一笔是一条路径而不是矩形，所以没有办法把它存为 Mendeley 批注。保留你手写的应用，是把它存在这个模型之外，之后它在哪里重新出现就取决于应用了。Rectoly 把它作为文件存在文献条目上，并在你阅读的任何地方（iPad、iPhone、Windows 或 Mac）把它重新画回页面上，但 Mendeley 自己的阅读器没有可渲染的墨迹类型，所以在那里它仍然是一个文件。
如果我在另一个阅读器里批注了下载的 PDF，能把这些标记弄进 Mendeley 吗？
不能作为批注弄进去。你通常可以导出一份把标记固化进去的扁平化副本并附到条目上，但结果是你批注的图像，而不是 Mendeley 能搜索或编辑的批注。
我已有的 Mendeley 批注会在 iPad 上显示吗？
用会同步的应用，会。批注既被写入也被读取，所以你在电脑上标记的内容在你打开论文时就在那里。
结语
在把一个学期的阅读交给某个工作流之前，值得弄清楚你的哪些标记是文献库里的结构化数据，哪些是某个文件里的像素。
高亮、下划线和便签可以是前者。手写不行，这不是某一个应用的缘故，而是因为这种格式没有它的形状。应用能做的，是把你的手写放在一个合理的地方，并诚实地告诉你那是哪里。