Zotero sur iPad en 2026 : Rectoly, PaperShip, l’app Zotero et GoodNotes, comparatif des apps pour lire des articles

Il existe quatre façons réalistes de lire et d’annoter un article Zotero sur un iPad : l’app de Zotero elle-même, PaperShip, une app de prise de notes comme GoodNotes à laquelle on transmet le PDF, et Rectoly for Zotero.

Je fais Rectoly, lisez donc cette colonne avec le même scepticisme que vous appliqueriez au comparatif de n’importe quel éditeur. Tout ce qui suit a été vérifié le 24 septembre 2026 sur les fiches de l’App Store et les forums Zotero, et chaque affirmation venue d’ailleurs renvoie à sa source. Si quelque chose est faux, dites-le-moi et je le corrigerai.

La version courte

Le reste de cet article est le raisonnement derrière chaque case.

Ce que veut dire « revenir dans Zotero »

C’est la colonne qui compte le plus, et celle où il est le plus facile de se tromper, elle vient donc en premier.

Zotero ne garde pas vos surlignages à l’intérieur du PDF. Il les stocke comme éléments d’annotation dans votre bibliothèque, chacun rattaché à l’article, et les synchronise comme n’importe quel autre élément. C’est pourquoi un surlignage fait sur l’ordinateur apparaît sur le téléphone, et pourquoi le format de Zotero a une place pour l’encre à main levée qui manque à la plupart des gestionnaires de références (les détails sont dans Ce que Zotero fait de vos annotations sur iPad).

Pour chaque option, la question n’est donc pas « puis-je dessiner sur la page » mais « le dessin devient-il une annotation Zotero ». Si oui, il suit l’article partout. S’il est écrit dans le fichier PDF à la place, le lecteur de Zotero l’affiche comme une partie de l’image de la page et il ne peut pas être modifié, recherché ou supprimé comme une annotation. Zotero 7 peut importer les annotations d’un PDF après coup, mais un fil du forum d’août 2025 rapporte que l’encre à main levée et les notes en texte libre ne passent pas.

L’app de Zotero elle-même

Le point de référence. Elle est gratuite, faite par les gens qui font Zotero, et ses annotations sont les vraies : surlignages, notes, sélections de zone et encre de l’Apple Pencil se synchronisent tous comme annotations Zotero, y compris dans les bibliothèques de groupe. Elle lit aussi les EPUB et les instantanés web, ce que rien d’autre ici ne fait.

Deux choses qu’elle ne fait pas, toutes deux confirmées par l’équipe de Zotero sur les forums. Elle n’ouvre pas les PDF dans une app externe, et elle ne lit pas les fichiers liés, c’est-à-dire les PDF que ZotFile ou ZotMoov ont déplacés dans un dossier Dropbox ou Google Drive (External pdf reader support on iPad, juillet 2025). Si votre bibliothèque est construite sur des fichiers liés, la solution de contournement proposée sur les forums est de déplacer quelques articles dans Zotero Storage avant un déplacement et de les remettre ensuite (iPad for reading annotating pdf books then sync back).

Elle affiche aussi le PDF tel qu’il est mis en page, donc un article à deux colonnes sur un écran de 11 pouces, c’est zoomer et faire défiler latéralement. Que cela vous gêne dépend de combien vous lisez sur l’iPad et de combien sur un ordinateur portable.

PaperShip

PaperShip a été, pendant des années, la réponse à cette question. Il lit une bibliothèque Zotero ou Mendeley et annote les PDF avec des surlignages, des notes, des dessins et des tampons, et il a 926 notes sur l’App Store américain pour en témoigner.

Les faits en septembre 2026 : la version actuelle est la 3.8.5, publiée le 13 novembre 2019, et il n’y a eu aucune mise à jour depuis. Des avis récents sur l’App Store rapportent que la connexion à Zotero n’aboutit plus (un avis d’octobre 2025 décrit l’échec de la négociation OAuth, un avis de mars 2026 dit que l’app n’a pas intégré l’étape de captcha que Zotero a ajoutée à sa connexion), et un avis de janvier 2025 dit que les annotations ne se synchronisent plus avec Mendeley. Je n’ai pas pu vérifier moi-même le comportement actuel de la connexion, alors lisez « cassée » comme « signalée cassée, non corrigée depuis un an ».

Si la connexion fonctionne pour vous, rappelez-vous que ses annotations sont écrites dans le fichier PDF. Le lecteur de Zotero les affichera, mais comme une partie de la page, pas comme des annotations que vous pouvez modifier ou extraire.

GoodNotes, avec le PDF transmis

À strictement parler, ce n’est pas du tout une app Zotero, mais c’est ainsi que beaucoup de gens travaillent réellement, donc elle a sa place ici. Vous ouvrez l’article dans l’app de Zotero, partagez le PDF vers GoodNotes, et lisez et écrivez là. Le stylo de GoodNotes est excellent et ses notes (455 000) le reflètent.

Ce que vous abandonnez, c’est la bibliothèque. GoodNotes détient une copie du fichier, et tout ce que vous écrivez reste dans cette copie. Pour ramener un surlignage dans Zotero, vous exportez le PDF annoté, le joignez à l’élément et lancez l’import de Zotero, qui récupère les surlignages et les notes mais pas votre écriture manuscrite (le fil lié plus haut). La plupart des gens ne le font pas, et leurs notes de lecture finissent par vivre définitivement dans GoodNotes, séparées de la fiche de l’article dans Zotero.

Le prix est de 28,99 $ une fois ou 11,99 $ par an pour la formule Essential. Si vous payez déjà GoodNotes pour d’autres raisons, le coût marginal est nul, ce qui est un vrai argument en sa faveur.

Rectoly for Zotero

Rectoly est un lecteur tiers payant. Il se connecte à votre compte Zotero via l’API officielle, lit votre bibliothèque et vos bibliothèques de groupe, et réécrit les surlignages, soulignements, notes et l’encre de l’Apple Pencil comme annotations Zotero, de sorte qu’ils apparaissent dans Zotero sur l’ordinateur après la synchronisation suivante et se comportent comme des annotations faites là.

Les deux choses qui le distinguent de l’app officielle sont le mode lecture, qui remet un article à deux colonnes en une seule colonne dans laquelle vous pouvez surligner et écrire, et les fichiers liés : si le dossier Dropbox ou Drive qu’utilise ZotFile ou ZotMoov est disponible sur l’iPad, Rectoly ouvre le PDF depuis là et envoie tout de même les annotations à Zotero. Les articles que vous ajoutez sur l’iPad vont dans Zotero Storage comme d’habitude. Si vos pièces jointes se synchronisent via votre propre serveur WebDAV plutôt que Zotero Storage, Rectoly y lit et y écrit de la même façon, depuis la version 4.0.

Les limites, honnêtement. C’est 19,99 $, une fois, après 14 jours d’essai, et l’app de Zotero est gratuite. Il ne lit que les PDF, pas les EPUB ni les instantanés. Et c’est un projet indépendant : la fiche App Store date de septembre 2026, et c’est dans le guide d’utilisation que son comportement réel est documenté, y compris ce qu’il ne fait pas.

Lequel choisir

• Vous lisez surtout sur un ordinateur portable et vérifiez parfois quelque chose sur l’iPad : l’app de Zotero. Elle est gratuite et ses annotations sont exactement ce qu’il faut.
• Votre bibliothèque est construite sur des fichiers liés ZotFile ou ZotMoov : l’app de Zotero ne peut pas les ouvrir. Soit la routine « déplacer puis remettre » des forums, soit Rectoly. Les deux, et une troisième voie, sont détaillées dans Les fichiers liés de Zotero sur iPad.
• Vous lisez des heures sur l’iPad et la mise en page à deux colonnes vous use : le mode lecture de Rectoly est la seule remise en une colonne de cette liste.
• L’écriture manuscrite est votre principale façon de penser et vous n’en avez pas besoin dans Zotero : GoodNotes, avec le PDF transmis.
• PaperShip avait du sens jusqu’en 2019. Tant qu’il n’est pas mis à jour, il est difficile de le recommander à quiconque doit se connecter aujourd’hui.

Si vous voulez vérifier vous-même la colonne Zotero, l’app est gratuite ; si vous voulez vérifier la colonne Rectoly, l’essai dure 14 jours et ne demande pas de carte. Les fils de forum liés plus haut sont le meilleur endroit pour voir ce que d’autres ont rencontré.