自從 Elsevier 在 2021 年 3 月 15 日停用行動 App 以來，Mendeley 就再也沒有 iPad App 了（來龍去脈見Mendeley 的行動 App 怎麼了？）。於是在 iPad 上讀一篇 Mendeley 論文，實際可行的方法剩下四種：在 Safari 裡開啟 Mendeley 自己的網頁版文獻庫、PaperShip、把 PDF 下載進 GoodNotes 這類筆記 App，以及 Rectoly for Mendeley。
Rectoly 是我做的，所以讀那一欄時，請帶著你看任何廠商自家比較表時的那份懷疑。下面的一切都在 2026 年 9 月24 日按 App Store 的頁面核對過，來自別處的每項說法都附了連結。如果有錯，告訴我，我會更正。
一表看完
| Mendeley 網頁版（Safari） | PaperShip | GoodNotes（下載 PDF） | Rectoly for Mendeley |
|---|
| 開發者 | Elsevier | Shazino | Goodnotes | 獨立開發者 |
| App Store 最近一次更新 | 網頁應用程式，沒有版本可查 | 2019 年 11 月 13 日（3.8.5） | 2026 年 9 月 21 日（7.1.24） | 2026 年 9 月 24 日（4.0.0） |
| 價格 | 有 Mendeley 帳號即免費 | 免費，標註工具需 App 內購買 | 一次性 28.99 美元，或每年 11.99 美元 | 14 天試用後一次性 49.99 美元 |
| 能開啟你的 Mendeley 文獻庫 | 能 | 2025 年有回報指 Mendeley 同步已失效 | 不能，一次只能處理一個 PDF | 能 |
| 螢光筆標記和筆記回到 Mendeley | 能 | 有回報指不會同步 | 不能，留在 GoodNotes 裡 | 能，儲存進 PDF 並寫回 |
| Apple Pencil 手寫 | 沒有墨跡工具 | 畫進 PDF 檔案 | 能，留在 GoodNotes 裡 | 能，作為 Rectoly 附件跟論文放在一起 |
| 把雙欄論文重排成單欄 | 否 | 否 | 否 | 是（閱讀模式） |
| 離線閱讀 | 否 | 可以，下載後 | 可以 | 可以，下載後 |
| Mac 和 Windows 上也有 | Mendeley Reference Manager | Mac（同一個 2019 年的版本） | Mac | Mac 和 Windows，同一次購買 |
本文其餘部分是每一格背後的理由。
「回到 Mendeley」是什麼意思
Mendeley 的標註模型包括螢光筆標記、便利貼筆記和底線，每一個都有在頁面上的位置，但沒有自由手寫墨跡這種類型。（這對手寫意味著什麼，在 如何在 iPad 上標註 Mendeley 的 PDF 裡有詳細分析。）所以對每種方法，問題其實是兩個：螢光筆標記和筆記能不能到達你的 Mendeley 文獻庫，以及手寫最後留在哪裡。
如果螢光筆標記能到達 Mendeley，它們就會出現在你電腦上的 Mendeley Reference Manager 裡，隨論文一起匯出，而且不管你在 iPad 上用的是哪個 App 都能留存下來。如果到不了，標註過的那份和編目入庫的那份就是兩個不同的檔案，而把它們對應起來的只有你自己。
Safari 裡的 Mendeley 網頁版
這是誰都不用安裝的方法。在 iPad 上登入 mendeley.com，開啟文獻庫，開啟一個 PDF，瀏覽器裡的閱讀器就能讓你畫螢光筆和加筆記，並直接儲存到你的文獻庫。你在這裡做的一切都是真正的 Mendeley 資料。
它缺的是讓 iPad 成為 iPad 的那一切。沒有墨跡工具，所以 Apple Pencil 只能點按和捲動。沒有離線存取：在飛機上一篇論文都打不開。PDF 按原版面顯示，所以雙欄論文意味著不停地縮放和平移。而且瀏覽器不像閱讀器 App 那樣記住你讀到哪裡。查一篇論文它是對的選擇，讀一下午它就是錯的選擇。
PaperShip
多年來，無論對 Mendeley 還是 Zotero 使用者，PaperShip 都是這個問題的答案。它能讀取文獻庫，用螢光筆標記、筆記、塗畫和圖章標註 PDF，美國 App Store 上的 926 則評分就是明證。
截至 2026 年 9 月的事實是：目前版本是 2019 年 11 月 13 日發布的 3.8.5，此後再無更新。App Store 上近期的評論說 Mendeley 這一側已經不能用了：2025 年 1 月的一則評論說在 PaperShip 裡做的標註不會同步到 Mendeley，2025 年10 月和 2026 年 3 月的評論則回報 Zotero 登入無法完成。我沒有親自驗證它現在的行為，所以請把這理解為「有回報指已失效，一年多未修復」。
即使它對你還能用，它的標註也是畫進 PDF 檔案裡的。在這台裝置上讀沒問題，哪天你想在別處用它們，就是問題了。
把 PDF 下載進 GoodNotes
這不是 Mendeley App，卻是很多人實際的工作方式。從網頁版文獻庫下載 PDF（步驟見如何把 Mendeley 的 PDF 放進 iPad），在 GoodNotes 裡開啟，然後在那裡讀、在那裡寫。GoodNotes 的筆極好，455,000 則評分說明了這一點。
你放棄的是文獻庫。GoodNotes 持有的是檔案的一份副本，你在裡面寫的任何東西都不會靠近 Mendeley 半步。要把標註過的副本弄回去，你得匯出一份壓平的 PDF，再手動附加到項目上，而這時 Mendeley 只會把螢光筆標記當作頁面的一部分顯示，而不是它認識的標註。大多數人不會這麼做，他們的閱讀筆記就永久地留在 GoodNotes 裡，和論文的記錄分離。
價格是一次性 28.99 美元，或 Essential 方案每年 11.99 美元。如果你已經因為別的用途在為 GoodNotes 付費，邊際成本就是零，這是支持它的一個實在理由。
Rectoly for Mendeley
Rectoly 是一款付費的第三方閱讀器。它用你的 Mendeley 帳號登入，把文獻庫帶到裝置上，並用一個為閱讀而打造的閱讀器開啟每一篇論文。螢光筆標記和文字筆記儲存進 PDF 並寫回 Mendeley，所以它們會出現在你電腦上的 Mendeley Reference Manager 裡，離開 Rectoly 也仍然是你的。
手寫是購買前需要弄清楚的部分。Mendeley 沒有墨跡標註類型，所以 Rectoly 把你的 Apple Pencil 筆跡儲存為一個單獨的檔案，附加到 Mendeley 裡的論文上。Mendeley 本身不會繪製這個檔案；你其他裝置上的 Rectoly 會，而且它會備份到iCloud、附版本歷史，並可匯出為 JSON。實際效果是，你的手寫會跟著論文在 iPad、Mac 和 Windows PC 之間流轉，但不會出現在 Mendeley 自己的閱讀器裡。
它和網頁版文獻庫的兩個不同之處是閱讀模式和離線閱讀。閱讀模式把雙欄論文重排成單欄，你可以在上面畫螢光筆和書寫；離線閱讀則讓下載過的論文和它們的標註留在裝置上。
坦白說說它的限制。它的價格是 14 天試用後一次性 49.99 美元，比 Zotero 版貴，因為 Mendeley 的 API 讓 App 這一側要做更多工作。它與 Elsevier 無關，而且必須有 Mendeley 帳號。而且它是一個獨立專案：使用指南記錄了它的實際行為，包括它做不到的事。
選哪個
- 你主要在筆記型電腦上讀，偶爾在 iPad 上查一篇論文： Safari 裡的網頁版文獻庫。不用安裝，螢光筆標記也是真的。
- 你在 iPad 上一讀幾個小時，還要離線，讀完之後螢光筆標記要留在 Mendeley 裡： Rectoly。這裡只有它能同時做到這三點。
- 手寫是你思考的主要方式，而且不需要把它放進 Mendeley： 把 PDF 下載進 GoodNotes。
- PaperShip 在 2019 年以前是合理的選擇。在它更新之前，很難推薦給今天需要 Mendeley 同步的人。
如果你想親自驗證 Rectoly 那一欄，試用期是 14 天，不需要信用卡。如果你想驗證網頁版文獻庫，它已經在那裡了。