自 Elsevier 于 2021 年 3 月 15 日停用移动应用以来，Mendeley 就再没有 iPad 应用了（来龙去脉见Mendeley 的移动应用怎么了？）。于是在 iPad 上读一篇 Mendeley 论文，现实可行的方法剩下四种：在 Safari 里打开 Mendeley 自己的网页版文献库、PaperShip、把 PDF 下载进 GoodNotes 这样的笔记应用，以及 Rectoly for Mendeley。
Rectoly 是我做的，所以读那一列时，请带着你看任何厂商自家对比表时的那份怀疑。下面的一切都在 2026 年 9 月24 日按 App Store 的页面核对过，来自别处的每条说法都附了链接。如果有错，告诉我，我会改正。
一表看完
| Mendeley 网页版（Safari） | PaperShip | GoodNotes（下载 PDF） | Rectoly for Mendeley |
|---|
| 开发者 | Elsevier | Shazino | Goodnotes | 独立开发者 |
| App Store 最近一次更新 | 网页应用，没有版本可查 | 2019 年 11 月 13 日（3.8.5） | 2026 年 9 月 21 日（7.1.24） | 2026 年 9 月 24 日（4.0.0） |
| 价格 | 有 Mendeley 账号即免费 | 免费，批注工具需内购 | 一次性 28.99 美元，或每年 11.99 美元 | 14 天试用后一次性 49.99 美元 |
| 能打开你的 Mendeley 文献库 | 能 | 2025 年有报告称 Mendeley 同步已失效 | 不能，一次只能处理一个 PDF | 能 |
| 高亮和笔记回到 Mendeley | 能 | 有报告称不同步 | 不能，留在 GoodNotes 里 | 能，保存进 PDF 并写回 |
| Apple Pencil 手写 | 没有墨迹工具 | 画进 PDF 文件 | 能，留在 GoodNotes 里 | 能，作为 Rectoly 附件跟论文放在一起 |
| 把双栏论文重排成单栏 | 否 | 否 | 否 | 是（阅读模式） |
| 离线阅读 | 否 | 可以，下载后 | 可以 | 可以，下载后 |
| Mac 和 Windows 上也有 | Mendeley Reference Manager | Mac（同一个 2019 年的版本） | Mac | Mac 和 Windows，同一次购买 |
本文其余部分是每一格背后的理由。
“回到 Mendeley”是什么意思
Mendeley 的批注模型包括高亮、便签笔记和下划线，每一个都有在页面上的位置，但没有自由手写墨迹这种类型。（这对手写意味着什么，在 如何在 iPad 上批注 Mendeley 的 PDF 里有详细分析。）所以对每种方法，问题其实是两个：高亮和笔记能不能到达你的 Mendeley 文献库，以及手写最后留在哪里。
如果高亮能到达 Mendeley，它们就会出现在你电脑上的 Mendeley Reference Manager 里，随论文一起导出，并且不管你在 iPad 上用的是哪个应用都能留存下来。如果到不了，批注过的那份和编目入库的那份就是两个不同的文件，而把它们对应起来的只有你自己。
Safari 里的 Mendeley 网页版
这是谁都不用安装的方法。在 iPad 上登录 mendeley.com，打开文献库，打开一个 PDF，浏览器里的阅读器就能让你高亮和添加笔记，并直接保存到你的文献库。你在这里做的一切都是真正的 Mendeley 数据。
它缺的是让 iPad 成为 iPad 的那一切。没有墨迹工具，所以 Apple Pencil 只能点按和滚动。没有离线访问：在飞机上一篇论文都打不开。PDF 按原版式显示，所以双栏论文意味着不停地缩放和平移。而且浏览器不像阅读器应用那样记住你读到哪里。查一篇论文它是对的选择，读一下午它就是错的选择。
PaperShip
多年来，无论对 Mendeley 还是 Zotero 用户，PaperShip 都是这个问题的答案。它能读取文献库，用高亮、笔记、涂画和图章批注 PDF，美国 App Store 上的 926 条评分就是明证。
截至 2026 年 9 月的事实是：当前版本是 2019 年 11 月 13 日发布的 3.8.5，此后再无更新。App Store 上近期的评论说 Mendeley 这一侧已经不能用了：2025 年 1 月的一条评论说在 PaperShip 里做的批注不会同步到 Mendeley，2025 年10 月和 2026 年 3 月的评论则报告 Zotero 登录无法完成。我没有亲自验证它现在的行为，所以请把这理解为“有报告称已失效，一年多未修复”。
即使它对你还能用，它的批注也是画进 PDF 文件里的。在这台设备上读没问题，哪天你想在别处用它们，就是问题了。
把 PDF 下载进 GoodNotes
这不是 Mendeley 应用，却是很多人实际的工作方式。从网页版文献库下载 PDF（步骤见如何把 Mendeley 的 PDF 放进 iPad），在 GoodNotes 里打开，然后在那里读、在那里写。GoodNotes 的笔极好，455,000 条评分说明了这一点。
你放弃的是文献库。GoodNotes 持有的是文件的一份副本，你在里面写的任何东西都不会靠近 Mendeley 半步。要把批注过的副本弄回去，你得导出一份压平的 PDF，再手动附加到条目上，而这时 Mendeley 只会把高亮当作页面的一部分显示，而不是它认识的批注。大多数人不会这么做，他们的阅读笔记就永久地留在 GoodNotes 里，和论文的记录分离。
价格是一次性 28.99 美元，或 Essential 方案每年 11.99 美元。如果你已经因为别的用途在为 GoodNotes 付费，边际成本就是零，这是支持它的一个实在理由。
Rectoly for Mendeley
Rectoly 是一款付费的第三方阅读器。它用你的 Mendeley 账号登录，把文献库带到设备上，并用一个为阅读而造的阅读器打开每一篇论文。高亮和文字笔记保存进 PDF 并写回 Mendeley，所以它们会出现在你电脑上的 Mendeley Reference Manager 里，离开 Rectoly 也仍然是你的。
手写是购买前需要弄清楚的部分。Mendeley 没有墨迹批注类型，所以 Rectoly 把你的 Apple Pencil 笔迹保存为一个单独的文件，附加到 Mendeley 里的论文上。Mendeley 本身不会绘制这个文件；你其他设备上的 Rectoly 会，而且它会备份到iCloud、带版本历史，并可导出为 JSON。实际效果是，你的手写会跟着论文在 iPad、Mac 和 Windows PC 之间流转，但不会出现在 Mendeley 自己的阅读器里。
它和网页版文献库的两个不同之处是阅读模式和离线阅读。阅读模式把双栏论文重排成单栏，你可以在上面高亮和书写；离线阅读则让下载过的论文和它们的批注留在设备上。
坦白说说它的限制。它的价格是 14 天试用后一次性 49.99 美元，比 Zotero 版贵，因为 Mendeley 的 API 让应用这一侧要做更多工作。它与 Elsevier 无关，并且必须有 Mendeley 账号。而且它是一个独立项目：使用指南记录了它的实际行为，包括它做不到的事。
选哪个
- 你主要在笔记本电脑上读，偶尔在 iPad 上查一篇论文： Safari 里的网页版文献库。不用安装，高亮也是真的。
- 你在 iPad 上一读几个小时，还要离线，读完之后高亮要留在 Mendeley 里： Rectoly。这里只有它能同时做到这三点。
- 手写是你思考的主要方式，而且不需要把它放进 Mendeley： 把 PDF 下载进 GoodNotes。
- PaperShip 在 2019 年以前是合理的选择。在它更新之前，很难推荐给今天需要 Mendeley 同步的人。
如果你想亲自验证 Rectoly 那一列，试用期是 14 天，不需要银行卡。如果你想验证网页版文献库，它已经在那里了。